首先，安装Certbot和阿里云DNS插件（假设你正在使用Debian/Ubuntu系统）：

Bash
1# 更新系统软件包
2 
 sudo apt-get update
3
 sudo apt-get install software-properties-common
4
5# 添加Certbot PPA源
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 sudo add-apt-repository ppa:certbot/certbot
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8# 更新源并安装Certbot
9
 sudo apt-get update
10
 sudo apt-get install certbot python3-certbot-dns-alidns
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12# 或如果你的系统不支持certbot-dns-alidns插件，你需要先安装certbot plugins再单独安装插件
13# 
sudo certbot plugins install certbot-dns-alidns

接下来，配置阿里云Access Key：

Bash
1# 创建或编辑环境变量文件，这里以root用户为例
2
 sudo nano /root/.bashrc
 3
 4# 在文件末尾添加你的阿里云密钥
 5
 export ALIDNS_ACCESS_KEY_ID="your_access_key_id"
 6
 export ALIDNS_ACCESS_KEY_SECRET="your_access_key_secret"
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 8# 保存并关闭文件，然后刷新环境变量
 9
 source /root/.bashrc

申请证书并设置自动续签：

Bash
1# 申请证书，--dns-alidns选项指定了使用阿里云DNS插件进行验证
2
certbot certonly --dns-alidns -d yourdomain.com -d www.yourdomain.com --email your-email@example.com --agree-tos --non-interactive
3
4# 设置自动续签（可选，取决于你的系统cron服务）
5
echo "0 0,12 * * * /usr/bin/certbot renew --quiet" | sudo tee -a /etc/cron.d/certbot

以上步骤是基础操作指导，实际使用时请根据具体情况和官方文档进行操作，并注意保护好你的阿里云密钥信息。